Ar Omikronas atsirado iš pelių?

Ar Omikronas atsirado iš pelių?

Praėjusią Padėkos dieną Rilu, vienuolikos metų snieginis leopardas ir septynių vaikų tėvas, pradėjo čiaudėti ir švokšti. Sniego leopardai kilę iš Himalajų, tačiau Rilu gimė zoologijos sode Oklahoma Sityje, o vėliau 2011 m. persikėlė į Miller Park zoologijos sodą Ilinojaus valstijoje, kad sudarytų dalį Rūšių išlikimo plano – zoologijos sodų piršlybų pastangų išlaikyti genetiškai įvairi „draudimo“ nykstančių gyvūnų populiacija. Gruodžio pradžioje atliktas PGR tyrimas patvirtino, kad Rilu turėjo covid-19. Nepaisant įvairių bandymų gydytis, jis susirgo plaučių uždegimu ir tapo silpnesnis. Sausio 6 d. jis tapo penktuoju nelaisvėje laikomu snieginiu leopardu JAV, nuo kurio mirė covid-19 komplikacijų per tris mėnesius. Gamtosaugininkų skaičiavimais, gamtoje yra maždaug penki tūkstančiai sniego leopardų. Penki leopardai rūšies lygmeniu prilygsta 7,9 milijono žmonių arba beveik kiekvienam Niujorko gyventojui. (Daugiau nei 5,7 mln. žmonių mirė nuo covid-19 visame pasaulyje, per dvejus metus.) Leopardų mirtis, ko gero, yra tragiškiausias pandemijos atvirkštinių zoonozių pavyzdys – kai žmonės perduoda patogeną atgal gyvūnams.

Nes protėvių SARS-CoV-2 iš pradžių išsivystė šikšnosparniuose, vėliau kažkokiu būdu atsidūrė žmonėms, vadinama „zoonoze“ – liga, kuria nuo gyvūnų perduodama mums. Maždaug septyniasdešimt penki procentai visų naujų infekcinių ligų yra zoonozė. Tačiau, kaip mokslininkai sužinojo pirmaisiais pandemijos mėnesiais, SARS-CoV-2 lengvai perduodamas atgal į kitas rūšis. Tai taip pat nėra išrankus virusas. „Neįsivaizduoju nė vieno zoonozinio viruso, kurio šeimininkų diapazonas būtų toks pat platus“, – man pasakė ligų ekologė Barbara Han.

Pirmiausia Bronkso zoologijos sode buvo naminiai šunys ir katės, paskui tigrai ir liūtai. Užkrėstų zoologijos sodo gyvūnų sąraše dabar yra gorilos, pumos, ūdros, dėmėtosios hyenos ir begemotai. Buvo įrodyta, kad dešimtys kitų rūšių yra jautrios SARS– CoV-2 eksperimentinėse infekcijose laboratorijoje, įskaitant karves, Afrikos žaliąsias beždžiones, makakas, babuinus, auksinius žiurkėnus, nykštukinius žiurkėnus, šeškus, usūrinius šunis, europinius triušius, elnių peles, pelėnus, skunksus, kiaunes ir medžių kirkšnies. Už zoologijos sodų ribų tyrėjai nustatė, kad laukinės baltauodegių elnių populiacijos visoje Šiaurės Amerikoje buvo užkrėstos SARS-CoV-2.

Visai neseniai, vasario 7 d., Penn State mokslininkai paskelbė dokumentą (dar nerecenzuotą), atskleidžiantį, kad Omicron variantas buvo plačiai paplitęs tarp baltauodegių elnių Stateno saloje. (Kraujo ir nosies mėginiai buvo paimti iš sterilizacijos programos, skirtos rajono elnių populiacijai kontroliuoti.) Neaišku, ar užsikrėtusiems elniams pasireiškia simptomai, tačiau panašu, kad jie išskiria ir platina virusą taip pat, kaip ir žmonės. Antikūnų analizės duomenys rodo, kad jie netgi gali būti imlūs pakartotinei infekcijai, o tai rodo, kad rūšis gali būti SARS-CoV-2 rezervuaras – nerimą kelianti mintis, turint omenyje, kad jų gyventojų yra maždaug trisdešimt milijonų ir jie klesti tarp žmonių. Tačiau ar pirmasis užsikrėtęs elnias pasiėmė jį nuo žmogaus ar kito gyvūno, „lieka atviras klausimas“, – sakė Peno valstijos virusologijos profesorius ir tyrimo pagrindinis mokslininkas Sureshas Kuchipudi. „Paslėptas viruso poveikis gyvūnams yra labiausiai nerimą kelianti viso šio proceso dalis.

kada SARS-CoV-2 išsilieja į naujus gyvūnų šeimininkus, jis prisitaiko, kaupdamas mutacijas, kurios gali sukelti naują variantą, kuris vėliau gali persilieti atgal į žmones. „Tikėjomės užbaigti šią pandemiją visus paskiepydami“, – sakė man Kuchipudi. „Tačiau kai virusas randa saugų prieglobstį kitam gyvūnui ar gyvūnams ir toliau cirkuliuoja, susidaro daug sudėtingesnis ekologinio perdavimo tinklas, kurį daug sunkiau suprasti ir valdyti.

Atvirkštinė zoonozė gali paaiškinti, iš kur atsirado Omicron. Po to, kai lapkritį Pietų Afrikoje jis pasirodė, jo genomą sekvenavę mokslininkai greitai pamatė kažką keisto. „Omicron“ turi beveik penkiasdešimt mutacijų, palyginti su originaliu 2019 m. virusu, ir trisdešimt septynios iš jų yra susitelkusios ant jo smaigalio baltymo; tai daug daugiau, nei buvo bet kuriame iš keturių kitų susirūpinimą keliančių variantų (Alfa, Beta, Gama ir Delta). ant SARS-CoV-2 šeimos medis – žemėlapis, sudarytas iš maždaug aštuonių milijonų viešai bendrinamų SARS-CoV-2 genomai – Omicron sėdi ant galūnės, išskirtinai ilgos šakos gale. Mokslininkai padarė išvadą, kad jis nebuvo kilęs iš kitų variantų, bet atrodė, kad jis vystėsi pagal savo trajektoriją. Bet kur jis pasislėpė?

Gruodį Pekine dirbantis mokslininkas Wenfeng Qian ir jo kolegų grupė pasiūlė galimą atsakymą: pelės. Straipsnyje, paskelbtame Genetikos ir genomikos žurnalasjie teigė, kad Omicron mutacijos patyrė didesnį spaudimą vystytis nei kitos SARS-CoV-2 variantai, kurie išsivystė žmonių šeimininkuose – galbūt tai rodo, kad jis išsivystė kitoms rūšims. Jie taip pat nustatė, kad kai kurios Omicron smaigalio mutacijos yra tos pačios mutacijos, kurios jau buvo rasta SARS– CoV-2 infekuotos pelės. (Mokslininkai nustatė šias mutacijas, kai sukūrė pelėms pritaikytas padermes SARS-CoV-2, kad būtų galima ištirti vakcinas ir gydymo priemones.) „Mūsų rezultatai rodo, kad Omicron pirmtakas perėjo nuo žmonių prie pelių, greitai susikaupė mutacijų, padedančių užkrėsti tą šeimininką, o paskui vėl sugrįžo į žmones“, – sakė Qianas ir jo bendradarbis. – rašė autoriai. Galima spėlioti, kaip užkrėstos pelės galėjo užkrėsti žmones.

Trevoras Bedfordas, Fredo Hutchinsono vėžio tyrimų centro Sietle profesorius ir pagrindinis virusų evoliucijos ir stebėjimo ekspertas, teigė, kad Qian dokumentas „yra įtikinamiausias mano matytas graužikų kilmės įrodymas“. Tačiau Bedfordas pritaria populiaresnei hipotezei, kad Omicron išsivystė chroniškai infekuotam, nusilpusio imuniteto pacientui, pavyzdžiui, ŽIV užsikrėtusiam asmeniui. „Manau, kad labiau tikėtina, kad užsikrės lėtinė infekcija“, – rašė jis el. laiške, – bet tikrai nesu tikras dėl šios kilmės. Richard Lessells, Pietų Afrikos infekcinių ligų gydytojas, priklausęs komandai, kuri iš pradžių nustatė Omicron, sutiko. „Mano nuomonė vis dar yra tokia, kad lėtinė infekcija ir žmogaus šeimininko evoliucija gali būti labiausiai tikėtinas mechanizmas.

„Omicron“ genome yra paslaptingas intarpas, kuris, Bedfordo nuomone, galėjo būti įgytas, kai jis kelis mėnesius replikavosi nusilpusio imuniteto žmogaus ląstelėse. Tačiau Qianas sakė, kad šis „fragmentas Omicron susideda tik iš devynių nukleotidų, todėl jis per trumpas, kad atskleistų jo šaltinį“. Jis ir jo bendraautoriai teigia, kad švelnesnis paaiškinimas yra tas, kad jis atkeliavo iš kitos vietos. SARS-Pats CoV-2 genomas. „Kiekvienas SARS„CoV-2 genomas turi šį fragmentą“, – rašė jis el. (Pasaulio sveikatos organizacijos sudaryta nauja grupė pandemijos ištakoms tirti – naujų patogenų kilmės mokslinė patariamoji grupė arba SAGO– šiuo metu baigia rengti ataskaitą, kurioje bus nagrinėjamas Omicron atsiradimas. Tačiau nesitikima, kad jos išvados, kurios daugiausia pagrįstos turimais duomenimis, išspręs diskusiją.)

Omicron greičiausiai išsivystė į dabartinę formą Pietų Afrikoje, kur jis buvo pirmą kartą aptiktas, arba kur nors platesniame regione, kur tiek skiepijimo rodikliai, tiek ligų stebėjimas yra žemas, kol jis pradėjo greitai užkrėsti žmones Pietų Afrikoje. Tačiau jo geografinė kilmė lieka neaiški, Marietjie Venter, Pietų Afrikos tyrėja ir SAGO, man sakė. Galbūt „tai čia buvo aptikta pirmiausia, nes beveik neturėjome SARS-CoV-2 iki spalio pabaigos ir jis gali nukonkuruoti Delta variantą iš dalies vengdamas imuninės sistemos. Ji pridūrė, kad vėliau jie išsiaiškino, kad variantas jau sklandė Europoje, kol jos grupė jį aptiko. Bet kokiu atveju, „šiuo metu“, – sakė Venteris, „atvirkštinio perdavimo į pelę hipotezė yra įdomi, tačiau šiame teoriniame etape“. Jis pagrįstas tik pelių padermių analize laboratorijose, o ne Omicron aptikimu laukinėse pelėse.

Taip gali būti dėl to, kad laukinių gyvūnų ligų stebėjimas yra sudėtingas, jei tai iš viso vyksta. Laboratorijoje buvo nustatyta, kad naminės ir elnių pelės yra ne tik jautrios SARS-CoV-2, bet gali perduoti virusą per aerozolines daleles (iš narvo į narvą). Mokslininkai teigia, kad gyvūnai gali užsikrėsti virusu žmonių nuotekose, kurių, kaip parodė tyrimai, gausu SARS-CoV-2 variantai. Numatyta, kad niujorkiečių gerai žinoma baltakopė pelė, kuri yra labai glaudžiai susijusi su elnių pele, gali būti jautri kompiuteriniam modeliui, kurį sukūrė Barbara Han ir jos kolegos. „Jis gana lengvai sugyvena su mumis“, – sakė ji ir kelia pavojų „nešti“. SARS-CoV-2, užsikrėsti ir perduoti toliau. Bet ar pelė galėtų perduoti a SARS-CoV-2 variantas žmonėms nežinomas. „Paprastai labai sunku gauti hermetiškus tokio pobūdžio įrodymus“, – sakė Hanas.

Iki šiol buvo žinomas tik vienas antrinis šalutinis įvykis – kada SARS– Nustatyta, kad CoV-2 užkrėtė audinę ir žaibiškai išplito kailių fermose visoje Europoje; vėliau Olandijoje virusas nuo audinės buvo perduotas atgal ūkininkams. Buvo išnaikinta tūkstančiai audinių, uždarytos fermos, sunaikinta kailių pramonė. Tačiau praėjusią savaitę mokslininkai nustatė, kad naminiai žiurkėnai greičiausiai pernešė Delta variantą į Honkongą, o tai sukėlė protrūkį naminių gyvūnėlių parduotuvėje, dėl kurio galiausiai užsikrėtė dešimtys žmonių.

Kadangi Honkonge veikia patikima kontaktų paieškos programa, kuri yra dalis platesnių pastangų, kad atvejų skaičius būtų lygus nuliui, pareigūnai galėjo lengvai nustatyti, kad protrūkis prasidėjo naminių gyvūnėlių parduotuvėje; tai būtų beveik neįmanoma Jungtinėse Valstijose ir daugelyje kitų vietų. Su laukine gamta – nestebima, dažniausiai nematoma – viskas įmanoma. „Atsižvelgiant į tai, kiek žmonių pasaulyje yra užsikrėtę“, – sakė Hanas, – tikimybė SARS-CoV-2 įsitvirtino naujame gyvūnų rezervuare ir tiesiog tampa šiuo endeminiu naujųjų šaltiniu SARSAtrodo, kad CoV-2 virusas yra gana didelis.

.

Parašykite komentarą

El. pašto adresas nebus skelbiamas.